MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 24589

< Previous12...38394041424344454647484950Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_007295	T	6	6	894422	894427	0 %	100 %	0 %	0 %	71894021
24502	NC_007295	GAT	2	6	894434	894439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71894021
24503	NC_007295	A	8	8	894448	894455	100 %	0 %	0 %	0 %	71894021
24504	NC_007295	A	6	6	894474	894479	100 %	0 %	0 %	0 %	71894021
24505	NC_007295	AAAATT	2	12	894547	894558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894021
24506	NC_007295	TCA	2	6	894569	894574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894021
24507	NC_007295	T	6	6	894598	894603	0 %	100 %	0 %	0 %	71894021
24508	NC_007295	ACTA	2	8	894655	894662	50 %	25 %	0 %	25 %	71894021
24509	NC_007295	AT	3	6	894683	894688	50 %	50 %	0 %	0 %	71894021
24510	NC_007295	TAA	2	6	894699	894704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894021
24511	NC_007295	T	6	6	894738	894743	0 %	100 %	0 %	0 %	71894021
24512	NC_007295	TGC	2	6	894787	894792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71894021
24513	NC_007295	ATTTTT	2	12	894832	894843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894021
24514	NC_007295	ATTT	2	8	894858	894865	25 %	75 %	0 %	0 %	71894021
24515	NC_007295	TTC	2	6	894883	894888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71894021
24516	NC_007295	AAG	2	6	894898	894903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71894021
24517	NC_007295	GATT	2	8	895006	895013	25 %	50 %	25 %	0 %	71894021
24518	NC_007295	TAA	2	6	895031	895036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24519	NC_007295	A	7	7	895065	895071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24520	NC_007295	TTAA	2	8	895083	895090	50 %	50 %	0 %	0 %	71894022
24521	NC_007295	T	7	7	895096	895102	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24522	NC_007295	T	6	6	895122	895127	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24523	NC_007295	AAATA	2	10	895151	895160	80 %	20 %	0 %	0 %	71894022
24524	NC_007295	AAT	2	6	895195	895200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894022
24525	NC_007295	A	6	6	895237	895242	100 %	0 %	0 %	0 %	71894022
24526	NC_007295	AAT	2	6	895249	895254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894022
24527	NC_007295	T	6	6	895272	895277	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24528	NC_007295	T	7	7	895282	895288	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24529	NC_007295	CATT	2	8	895308	895315	25 %	50 %	0 %	25 %	71894022
24530	NC_007295	T	8	8	895328	895335	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24531	NC_007295	TGC	2	6	895358	895363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71894022
24532	NC_007295	ATT	2	6	895388	895393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894022
24533	NC_007295	AGG	2	6	895434	895439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71894022
24534	NC_007295	A	6	6	895460	895465	100 %	0 %	0 %	0 %	71894022
24535	NC_007295	T	8	8	895571	895578	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24536	NC_007295	CAA	2	6	895587	895592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71894022
24537	NC_007295	GCT	2	6	895608	895613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71894022
24538	NC_007295	TGTT	2	8	895685	895692	0 %	75 %	25 %	0 %	71894022
24539	NC_007295	AAAT	2	8	895719	895726	75 %	25 %	0 %	0 %	71894022
24540	NC_007295	AAT	2	6	895729	895734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894022
24541	NC_007295	TAC	2	6	895744	895749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894022
24542	NC_007295	TTTTG	2	10	895911	895920	0 %	80 %	20 %	0 %	71894022
24543	NC_007295	T	6	6	895931	895936	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24544	NC_007295	TTA	2	6	895952	895957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894022
24545	NC_007295	T	7	7	896017	896023	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24546	NC_007295	T	6	6	896049	896054	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24547	NC_007295	TAA	2	6	896137	896142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894022
24548	NC_007295	AATT	2	8	896143	896150	50 %	50 %	0 %	0 %	71894022
24549	NC_007295	TAT	2	6	896217	896222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894022
24550	NC_007295	A	7	7	896230	896236	100 %	0 %	0 %	0 %	71894022
24551	NC_007295	GCA	2	6	896261	896266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71894022
24552	NC_007295	T	6	6	896403	896408	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24553	NC_007295	A	8	8	896434	896441	100 %	0 %	0 %	0 %	71894022
24554	NC_007295	ATT	2	6	896449	896454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894022
24555	NC_007295	T	6	6	896540	896545	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24556	NC_007295	T	6	6	896571	896576	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24557	NC_007295	T	6	6	896587	896592	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24558	NC_007295	A	6	6	896609	896614	100 %	0 %	0 %	0 %	71894022
24559	NC_007295	TTA	2	6	896615	896620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894022
24560	NC_007295	T	6	6	896621	896626	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24561	NC_007295	T	6	6	896657	896662	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24562	NC_007295	TCT	2	6	896696	896701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71894022
24563	NC_007295	AAG	2	6	896739	896744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71894022
24564	NC_007295	AAT	2	6	896791	896796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894022
24565	NC_007295	A	7	7	896804	896810	100 %	0 %	0 %	0 %	71894022
24566	NC_007295	A	7	7	896824	896830	100 %	0 %	0 %	0 %	71894022
24567	NC_007295	TTTAAA	2	12	896833	896844	50 %	50 %	0 %	0 %	71894022
24568	NC_007295	T	7	7	896847	896853	0 %	100 %	0 %	0 %	71894022
24569	NC_007295	ATT	2	6	896860	896865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894022
24570	NC_007295	AAT	2	6	896877	896882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894022
24571	NC_007295	A	6	6	896979	896984	100 %	0 %	0 %	0 %	71894023
24572	NC_007295	TTCT	2	8	896985	896992	0 %	75 %	0 %	25 %	71894023
24573	NC_007295	A	7	7	897018	897024	100 %	0 %	0 %	0 %	71894023
24574	NC_007295	T	6	6	897032	897037	0 %	100 %	0 %	0 %	71894023
24575	NC_007295	AT	3	6	897043	897048	50 %	50 %	0 %	0 %	71894023
24576	NC_007295	T	6	6	897105	897110	0 %	100 %	0 %	0 %	71894023
24577	NC_007295	A	7	7	897131	897137	100 %	0 %	0 %	0 %	71894023
24578	NC_007295	ATA	2	6	897149	897154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894023
24579	NC_007295	T	8	8	897183	897190	0 %	100 %	0 %	0 %	71894023
24580	NC_007295	ATT	2	6	897195	897200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894023
24581	NC_007295	T	8	8	897216	897223	0 %	100 %	0 %	0 %	71894023
24582	NC_007295	TAC	2	6	897226	897231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894023
24583	NC_007295	T	6	6	897235	897240	0 %	100 %	0 %	0 %	71894023
24584	NC_007295	CAA	2	6	897253	897258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24585	NC_007295	ATT	2	6	897261	897266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894024
24586	NC_007295	CGT	2	6	897302	897307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71894024
24587	NC_007295	GCA	2	6	897308	897313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71894024
24588	NC_007295	CG	4	8	897344	897351	0 %	0 %	50 %	50 %	71894024
24589	NC_007295	GT	3	6	897358	897363	0 %	50 %	50 %	0 %	71894024

< Previous12...38394041424344454647484950Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.